A presente orientação é estruturada de acordo com as diferentes fases no processo de auditoria operacional. A primeira seção refere-se ao planejamento da auditoria – como selecionar temas e desenhar a auditoria. A segunda seção refere-se à execução da auditoria, de modo a obter evidências suficientes e apropriadas para apoiar os achados e conclusões do auditor. A terceira seção refere-se ao relatório (o seu formato, conteúdo e distribuição). A quarta seção refere-se ao monitoramento dos achados e recomendações de relatórios de auditoria anteriores, para identificar e documentar o impacto da auditoria e o progresso realizado nos problemas avaliados.